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研究人員利用人工智能尋找下一個(gè)類似SARS-CoV-2的病毒

人工智能
由喬治敦大學(xué)的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國(guó)際研究小組展示了人工智能的力量,可以預(yù)測(cè)未來哪些病毒可能感染人類--比如SARS-CoV-2。

由喬治敦大學(xué)的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國(guó)際研究小組展示了人工智能的力量,可以預(yù)測(cè)未來哪些病毒可能感染人類--比如SARS-CoV-2,導(dǎo)致COVID-19大流行的病毒--哪些動(dòng)物是它們的宿主,以及它們可能出現(xiàn)的地方。

1月10日發(fā)表在《柳葉刀-微生物》上的對(duì)可能的貯藏庫(kù)宿主的預(yù)測(cè)模型組合(題為《優(yōu)化預(yù)測(cè)模型以優(yōu)先發(fā)現(xiàn)人畜共患病貯藏庫(kù)中的病毒》)在一個(gè)為期18個(gè)月的項(xiàng)目中得到了驗(yàn)證,該項(xiàng)目旨在確定可能攜帶betacoronaviruses(包括類似SARS病毒的一組)的特定蝙蝠物種。

"如果你想找到這些病毒,你必須從剖析它們的宿主開始--它們的生態(tài),它們的進(jìn)化,甚至它們翅膀的形狀,"該研究的高級(jí)作者,微生物學(xué)和免疫學(xué)系的助理研究教授、喬治敦大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的全球健康科學(xué)和安全中心的成員科林-卡爾森博士解釋道。"人工智能讓我們可以利用蝙蝠的數(shù)據(jù),并將其轉(zhuǎn)化為具體的預(yù)測(cè):我們應(yīng)該在哪里尋找下一個(gè)SARS?"

盡管在疾病監(jiān)測(cè)方面進(jìn)行了全球投資,但仍然難以識(shí)別和監(jiān)測(cè)有朝一日可能感染人類的野生動(dòng)物病毒庫(kù)。統(tǒng)計(jì)模型正被越來越多地用于確定在野外對(duì)哪些野生動(dòng)物物種進(jìn)行采樣的優(yōu)先次序,但任何一個(gè)模型所產(chǎn)生的預(yù)測(cè)都可能是高度不確定的。科學(xué)家們也很少在他們做出預(yù)測(cè)后跟蹤其成功或失敗的情況,這使得他們很難在未來學(xué)習(xí)并做出更好的模型。這些限制加在一起,意味著哪些模型可能最適合這項(xiàng)任務(wù),存在著高度的不確定性。

這項(xiàng)新的研究表明,尋找密切相關(guān)的病毒可能并不是一件簡(jiǎn)單的事情,據(jù)預(yù)測(cè),全世界有超過400種蝙蝠會(huì)寄生betacoronaviruses,這是一個(gè)很大的病毒族群,包括那些與SARS-CoV(導(dǎo)致2002-2004年爆發(fā)的SARS的病毒)和SARS-CoV-2(導(dǎo)致COVID-19的病毒)等呼吸道疾病有關(guān)的病毒。盡管SARS-CoV-2的來源仍不確定,但由于農(nóng)業(yè)擴(kuò)張和氣候變化等因素,其他病毒從常見宿主蝙蝠中溢出到人類群體是一個(gè)日益嚴(yán)重的問題。

喬治敦大學(xué)生物系的博士后Greg Albery說,COVID-19為加快他們的研究提供了動(dòng)力。"這是一個(gè)非常罕見的機(jī)會(huì),"Albery解釋說。"在大流行病之外,我們從來沒有在這么小的時(shí)間范圍內(nèi)對(duì)這些病毒了解這么多。相當(dāng)于以往十年的研究被壓縮到大約一年的出版物中,這意味著我們可以真正展示這些工具的作用。"

在2020年第一季度,研究人員團(tuán)隊(duì)訓(xùn)練了8個(gè)不同的統(tǒng)計(jì)模型,預(yù)測(cè)哪些種類的動(dòng)物可以承載betacoronaviruses。在一年多的時(shí)間里,該團(tuán)隊(duì)隨后跟蹤發(fā)現(xiàn)了40個(gè)新的betacoronaviruses的蝙蝠宿主,以驗(yàn)證最初的預(yù)測(cè)并動(dòng)態(tài)地更新他們的模型。研究人員發(fā)現(xiàn),利用蝙蝠生態(tài)學(xué)和進(jìn)化數(shù)據(jù)的模型在預(yù)測(cè)新宿主方面表現(xiàn)非常好。相比之下,來自網(wǎng)絡(luò)科學(xué)的尖端模型使用了高級(jí)數(shù)學(xué)--但生物數(shù)據(jù)較少--在隨機(jī)情況下的表現(xiàn)與預(yù)期的大致相同或更差。

俄克拉荷馬大學(xué)生物學(xué)助理教授丹尼爾-貝克爾博士說:"我們的研究給我們提供的最重要的成果之一是一個(gè)數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的候選名單,哪些蝙蝠物種應(yīng)該被進(jìn)一步研究。在確定了這些可能的宿主之后,下一步就是投資于監(jiān)測(cè),以了解betacoronaviruses在哪里以及何時(shí)可能溢出。"

卡爾森說,該團(tuán)隊(duì)現(xiàn)在正與世界各地的其他科學(xué)家合作,根據(jù)他們的預(yù)測(cè)測(cè)試蝙蝠樣本的冠狀病毒。

"如果我們花更少的錢、資源和時(shí)間來尋找這些病毒,我們就可以把所有這些資源投入到下一步真正拯救生命的事情上。我們可以投資建立針對(duì)這些病毒的通用疫苗,或者監(jiān)測(cè)生活在蝙蝠附近的人的溢出情況,這對(duì)科學(xué)和公共衛(wèi)生來說是雙贏的。"

 

責(zé)任編輯:趙寧寧 來源: 今日頭條
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